Prirodni biser je onaj koji nastaje sam u skoljci, bez ljudske intervencije . Postoje slatkovodni i morski biseri. Unutrasnje tkivo skoljke je vrlo osetljivo i kad zrno peska ili neko drugo strano telo udje unutra, to skoljka ne moze izbaciti i njoj stvara strahovitu bol. Ona se brani izlucivanjem smese koja obavija to zrno i pretvara ga u
biser.